Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarca5Q91ZW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca5Q91ZW3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms