Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx18Q91ZR2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx18Q91ZR2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms