Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atl3Q91YH5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atl3Q91YH5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms