Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm2Q91YD4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm2Q91YD4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpm2Q91YD4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms