Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usb1Q91W78 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usb1Q91W78 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms