Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cox4i2Q91W29 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox4i2Q91W29 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms