Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H1fooQ8VIK3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H1fooQ8VIK3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H1fooQ8VIK3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms