Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc115Q8VE99 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc115Q8VE99 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms