Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cul7Q8VE73 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul7Q8VE73 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms