Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrkQ8VDU5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrkQ8VDU5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms