Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ApobrQ8VBT6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms