Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc12Q8R344 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc12Q8R344 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms