Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg10Q8R1P4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg10Q8R1P4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms