Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc5Q8K4Z2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc5Q8K4Z2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc5Q8K4Z2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc5Q8K4Z2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fndc5Q8K4Z2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc5Q8K4Z2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms