Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PolbQ8K409 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolbQ8K409 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms