Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn1r72Q8K3N7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vmn1r72Q8K3N7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn1r72Q8K3N7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vmn1r72Q8K3N7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r72Q8K3N7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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