Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MyripQ8K3I4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MyripQ8K3I4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MyripQ8K3I4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms