Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap2Q8K389 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap2Q8K389 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms