Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssh3Q8K330 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssh3Q8K330 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms