Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prpf39Q8K2Z2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf39Q8K2Z2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms