Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2P7

Slc38a1, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 1, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a1Q8K2P7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a1Q8K2P7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc38a1Q8K2P7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Slc38a1Q8K2P7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a1Q8K2P7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Slc38a1Q8K2P7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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