Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkd3Q8K1Y2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prkd3Q8K1Y2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms