Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkn3Q8K045 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkn3Q8K045 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms