Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm17Q8JZX4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm17Q8JZX4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms