Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Afg3l2Q8JZQ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Afg3l2Q8JZQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Afg3l2Q8JZQ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l2Q8JZQ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l2Q8JZQ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l2Q8JZQ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l2Q8JZQ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Afg3l2Q8JZQ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms