Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rasgef1bQ8JZL7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms