Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trip10Q8CJ53 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trip10Q8CJ53 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms