Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nupl2Q8CIC2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nupl2Q8CIC2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms