Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mterf1aQ8CHZ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1aQ8CHZ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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