Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nav1Q8CH77 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nav1Q8CH77 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms