Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH20

Cypt1, Cysteine-rich perinuclear theca protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cypt1Q8CH20 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cypt1Q8CH20 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cypt1Q8CH20 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cypt1Q8CH20 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cypt1Q8CH20 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cypt1Q8CH20 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cypt1Q8CH20 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cypt1Q8CH20 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cypt1Q8CH20 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cypt1Q8CH20 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms