Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGQ8

Slc24a4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a4Q8CGQ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc24a4Q8CGQ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms