Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpf1Q8CFE2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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