Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf17Q8CFA7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf17Q8CFA7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms