Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms