Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef8Q8CE24 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pramef8Q8CE24 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Pramef8Q8CE24 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms