Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc63Q8CDV6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc63Q8CDV6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms