Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlrc3Q8CCH2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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