Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dclre1bQ8C7W7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dclre1bQ8C7W7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms