Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ubqln3Q8C5U9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubqln3Q8C5U9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubqln3Q8C5U9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms