Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ccdc113Q8C5T8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ccdc113Q8C5T8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ccdc113Q8C5T8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ccdc113Q8C5T8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ccdc113Q8C5T8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ccdc113Q8C5T8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc113Q8C5T8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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