Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnot2Q8C5L3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot2Q8C5L3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms