Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf428Q8C1M2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms