Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21aQ8C0S4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21aQ8C0S4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21aQ8C0S4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc21aQ8C0S4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ttc21aQ8C0S4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc21aQ8C0S4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc21aQ8C0S4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms