Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Nek11Q8C0Q4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Nek11Q8C0Q4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek11Q8C0Q4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.29■■□□□ 1
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