Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim35Q8C006 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim35Q8C006 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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