Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Iffo1Q8BXL9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Iffo1Q8BXL9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Iffo1Q8BXL9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Iffo1Q8BXL9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Iffo1Q8BXL9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Iffo1Q8BXL9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Iffo1Q8BXL9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Iffo1Q8BXL9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Iffo1Q8BXL9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Iffo1Q8BXL9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Iffo1Q8BXL9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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