Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sall4Q8BX22 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sall4Q8BX22 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms