Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ss18l1Q8BW22 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ss18l1Q8BW22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms