Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx17Q8BVL3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx17Q8BVL3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx17Q8BVL3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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